百度360必应搜狗淘宝本站头条
当前位置:网站首页 > 技术分析 > 正文

审稿人问了很多慢病毒载体包装的实验细节问题,该如何去解决呢?

liebian365 2025-03-25 14:58 1 浏览 0 评论

尔云间一个专门做科研的团队

原创 小薇 A科研显微镜

关注我们

第一时间放送各种科研干货


最近小薇收到一些咨询慢病毒包装相关的审稿意见咨询,正好汇总给大家一起来了解了解这块知识。



还有个更仔细的审稿意见,例如这样的:



上面两条审稿意见都是对慢病毒包装的方法部分的一些细节问题,如果之前对慢病毒包装实验原理和步骤不是那么了解的情况下,可能回答这些问题就还是有些吃力的。


今天小薇就给大家一起来再重温一下慢病毒载体的一些相关基础知识吧~后续内容会更精彩,欢迎持续关注和转发~


为什么要进行慢病毒包装?

在细胞相关的实验操作中,对于一些用常规方法难以转染的细胞,通常通过慢病毒感染的方式将靶基因随机整合到宿主的基因组中,从而增加转染效率,并能够在细胞系中稳定表达若干代,可进行稳定细胞株的筛选。慢病毒载体具有能稳定表达外源基因、感染谱广泛、有效感染处于分裂期和静止期的细胞等优点


图1 慢病毒包装过程(Bio Protoc. 2018 Nov 5;8(21):e3073.)


如上图所示,慢病毒包装过程一般为构建慢病毒表达载体、大量扩增慢病毒载体、在293T细胞内进行慢病毒载体的大量包装、慢病毒的浓缩及纯化、慢病毒滴度测定


如果有需求的小伙伴们可直接查看图一的文献中提供的整个慢病毒包装的实验材料和步骤,可供大家参考。不过现在许多公司都会合成已经做完滴度测定的现成的慢病毒包装载体,不需要自己再动手做这部分。但自己的实验还是需要了解清楚的,这样才可以解决上面审稿人的一些具体的实验细节问题。


慢病毒载体的迭代更新具体如何?

慢病毒载体来源于病原体HIV-1,如何增加该载体的生物安全性一直贯穿于整个载体的改造历史。


第一代慢病毒载体包括三质粒:

图2 第一代慢病毒包装(Biochem. J. (2012) 443, 603–618 (Printed in Great Britain) doi:10.1042/BJ20120146)


一个穿梭质粒:携带目的基因

一个包膜质粒:表达VSV-G

一个包装元件质粒:具有CMV强启动子,表达gag/pol以及各种辅助蛋白。

包装元件质粒与包膜蛋白质粒删掉了LTR和包装信号,避免它们被包装进入慢病毒载体颗粒中,降低了制备中复制型慢病毒(RCL)产生的可能性。


第二代慢病毒载体也包括三质粒:

图3 第二代慢病毒包装(Biochem. J. (2012) 443, 603–618 (Printed in Great Britain) doi:10.1042/BJ20120146)


第二代慢病毒载体包装系统删除了Vif、 Vpu、 Vpr 和Nef四个基因。加上用VSV-G取代HIV-1的env,第二代慢病毒载体只包含了HIV-1 的9个基因中的4个:gag、pol、tat、rev第二代在第一代的基础上,又提高了安全性。

穿梭质粒包含病毒LTR和ψ包装信号。如果不提供内部启动子,基因表达将由5'LTR驱动,5'LTR是弱启动子,需要提供tat才能激活表达,正因为如此,第二代慢病毒穿梭质粒必须与第二代包装系统一起使用。


第三代慢病毒载体包括四质粒:


图4 第三代慢病毒包装(Biochem. J. (2012) 443, 603–618 (Printed in Great Britain) doi:10.1042/BJ20120146)


到了第三代又双叒叕升级了,将包装质粒分成了两个,一个编码rev,另一个编码gag和pol。tat调节基因也被剔除,对5’LTR进行了改造,换上了异源启动子,从而不需依赖tat基因(Tat 基因编码蛋白可与LTR结合,增加病毒所有基因转录率),所以第二代或第三代包装系统能够包装第三代穿梭质粒。第三代慢病毒系统比第二代系统更安全,但更难用,因为要用四个单独的质粒转染才能包出有功能的慢病毒颗粒。


所以总结一下,要想包出一个完整病毒,我们一般需要如下几个质粒:


①一个穿梭质粒;②一个或两个包装质粒;③一个包膜质粒。

然后把这几个质粒共转进293T细胞,包装后的病毒将会被释放到上清液中,收集病毒上清液经浓缩后(也可以不浓缩,直接用上清液),就可以感染我们的目的细胞了。


如何进行慢病毒包装?



1. 首先进行载体构建(过表达、干扰)


2.然后将包装慢病毒过程中需要用到的三质粒(根据实际情况选取质粒)进行高纯度无内毒素抽提


3.细胞的选择及铺板:小薇选用的是293T细胞进行慢病毒的包装,良好的293T细胞状态是病毒包装的首要关键因素,细胞代数不宜超过30代。首先,第一天胰酶消化293T细胞,血球计数板计数,用新鲜的DMEM完全培养基重悬细胞,按适当比例将细胞铺于10cm平皿中,每皿培养基体积为10ml,置于37°C,5%CO2培养箱中培养,待第二天转染前细胞密度达到80%-90%即可;


4. 第二天进行质粒转染按一定比例将穿梭质粒、包装质粒、包膜质粒(不同的质粒采用的比例有所不同,需要进行摸索)溶于1500μl的opti-MEM中,轻柔混匀后,室温放置5min;将转染试剂PEI同样溶于1500μl的opti-MEM中,轻柔混匀后,室温放置5min;将静置5min后的质粒和转染试剂轻柔混合,室温放置20min,然后将混合液加入到培养皿中,轻轻混匀,不要将细胞吹起,置于37°C,5%CO2培养箱中培养;


5. 6-8h后,吸弃培养皿中的培养基,加入20mL新鲜的低血清DMEM培养基,置于37°C,5%CO2培养箱中继续培养;


6. 72h后,收细胞上清于50ml离心管中,用0.45μm滤器过滤;


7. 将病毒原液装进专用离心管中,利用超高速低温离心机进行浓缩,弃上清,静置2-3min左右,吸走多余液体,加入1mlOPTI-MEM溶解病毒沉淀,收集于1.5ml EP管中,置于4°C溶解过夜,溶解好后立即将病毒液分装,保存于-80°C。


看完这些基础知识和实验操作过程,是不是就完全可以去写回复信解决审稿人的疑虑啦~


下一期咱们来聊一聊慢病毒滴度检测的那些事儿~


有问题欢迎随时来撩~

相关推荐

go语言也可以做gui,go-fltk让你做出c++级别的桌面应用

大家都知道go语言生态并没有什么好的gui开发框架,“能用”的一个手就能数的清,好用的就更是少之又少。今天为大家推荐一个go的gui库go-fltk。它是通过cgo调用了c++的fltk库,性能非常高...

旧电脑的首选系统:TinyCore!体积小+精简+速度极快,你敢安装吗

这几天老毛桃整理了几个微型Linux发行版,准备分享给大家。要知道可供我们日常使用的Linux发行版有很多,但其中的一些发行版经常会被大家忽视。其实这些微型Linux发行版是一种非常强大的创新:在一台...

codeblocks和VS2019下的fltk使用中文

在fltk中用中文有点问题。英文是这样。中文就成这个样子了。我查了查资料,说用UTF-8编码就行了。edit->Fileencoding->UTF-8然后保存文件。看下下边的编码指示确...

FLTK(Fast Light Toolkit)一个轻量级的跨平台Python GUI库

FLTK(FastLightToolkit)是一个轻量级的跨平台GUI库,特别适用于开发需要快速、高效且简单界面的应用程序。本文将介绍Python中的FLTK库,包括其特性、应用场景以及如何通过代...

中科院开源 RISC-V 处理器“香山”流片,已成功运行 Linux

IT之家1月29日消息,去年6月份,中科院大学教授、中科院计算所研究员包云岗,发布了开源高性能RISC-V处理器核心——香山。近日,包云岗在社交平台晒出图片,香山芯片已流片,回片后...

Linux 5.13内核有望合并对苹果M1处理器支持的初步代码

预计Linux5.13将初步支持苹果SiliconM1处理器,不过完整的支持工作可能还需要几年时间才能完全完成。虽然Linux已经可以在苹果SiliconM1上运行,但这需要通过一系列的补丁才能...

Ubuntu系统下COM口测试教程(ubuntu port)

1、在待测试的板上下载minicom,下载minicom有两种方法:方法一:在Ubuntu软件中心里面搜索下载方法二:按“Ctrl+Alt+T”打开终端,打开终端后输入“sudosu”回车;在下...

湖北嵌入式软件工程师培训怎么选,让自己脱颖而出

很多年轻人毕业即失业、面试总是不如意、薪酬不满意、在家躺平。“就业难”该如何应对,参加培训是否能改变自己的职业走向,在湖北,有哪些嵌入式软件工程师培训怎么选值得推荐?粤嵌科技在嵌入式培训领域有十几年经...

新阁上位机开发---10年工程师的Modbus总结

前言我算了一下,今年是我跟Modbus相识的第10年,从最开始的简单应用到协议了解,从协议开发到协议讲解,这个陪伴了10年的协议,它一直没变,变的只是我对它的理解和认识。我一直认为Modbus协议的存...

创建你的第一个可运行的嵌入式Linux系统-5

@ZHangZMo在MicrochipBuildroot中配置QT5选择Graphic配置文件增加QT5的配置修改根文件系统支持QT5修改output/target/etc/profile配置文件...

如何在Linux下给zigbee CC2530实现上位机

0、前言网友提问如下:粉丝提问项目框架汇总下这个网友的问题,其实就是实现一个网关程序,内容分为几块:下位机,通过串口与上位机相连;下位机要能够接收上位机下发的命令,并解析这些命令;下位机能够根据这些命...

Python实现串口助手 - 03串口功能实现

 串口调试助手是最核心的当然是串口数据收发与显示的功能,pzh-py-com借助的是pySerial库实现串口收发功能,今天痞子衡为大家介绍pySerial是如何在pzh-py-com发挥功能的。一、...

为什么选择UART(串口)作为调试接口,而不是I2C、SPI等其他接口

UART(通用异步收发传输器)通常被选作调试接口有以下几个原因:简单性:协议简单:UART的协议非常简单,只需设置波特率、数据位、停止位和校验位就可以进行通信。相比之下,I2C和SPI需要处理更多的通...

同一个类,不同代码,Qt 串口类QSerialPort 与各种外设通讯处理

串口通讯在各种外设通讯中是常见接口,因为各种嵌入式CPU中串口标配,工业控制中如果不够还通过各种串口芯片进行扩展。比如spi接口的W25Q128FV.对于软件而言,因为驱动接口固定,软件也相对好写,因...

嵌入式linux为什么可以通过PC上的串口去执行命令?

1、uboot(负责初始化基本硬bai件,如串口,网卡,usb口等,然du后引导系统zhi运行)2、linux系统(真正的操作系统)3、你的应用程序(基于操作系统的软件应用)当你开发板上电时,u...

取消回复欢迎 发表评论: